Okulumuz, şimdiki yerinde III. Ahmet'in büyük kızı Esma Sultan'ın bahçeli ahşap konağı olarak tarihi bir geçmişe sahiptir. Cumhuriyetin ilanından sonra bu konak, 18. İlkokul adıyla eğitim ve öğretime açılmıştır. 15 Eylül 1949 tarihinde, 3701 m² bahçe ve ahşap konağın mülkiyeti İstanbul vilayeti adına tescil edilmiştir.
Zamanla binanın eski ve ahşap olması nedeniyle yıkılarak, 1954 yılında günümüzdeki bina inşa edilmiştir. Aynı yıl eğitim ve öğretime başlanmış ve bahçeli ahşap konağın sahibinin adını yaşatmak amacıyla okula "Büyük Esma Sultan İlkokulu" adı verilmiştir.
1989-1990 öğretim yılında, bahçe içindeki "Sinan Paşa İlkokulu" ile birleştirilerek "Büyük Esma Sultan İlkokulu" olarak devam edilmiştir. 1993-1994 öğretim yılında ise okulun adı "Büyük Esma Sultan İlköğretim Okulu" olarak değiştirilmiştir.
2012-2013 eğitim-öğretim yılında 4+4+4 sistemine geçiş yapılarak, hem ilkokul hem de ortaokul olarak hizmet verilmeye başlanmıştır. 2013-2014 eğitim-öğretim yılından itibaren okulumuz bünyesinde 2 şube anasınıfı ile birlikte iki bina ile "Büyük Esma Sultan Ortaokulu" olarak eğitim öğretim hizmeti sunulmaktadır.
2016-2017 eğitim-öğretim yılında B Blok binamız "Beşiktaş Halk Eğitim Merkezi"ne dönüştürülmüş, eğitim-öğretim faaliyetlerimiz ana binamızda, 1 şube anasınıfı ile toplam 15 derslikte devam etmiştir.
Tarih boyunca eğitime olan katkılarımızı sürdürmekteyiz ve geçmişten gelen değerlerimizi gelecek nesillere aktarmaktan gurur duymaktayız.